A Bionicle karaktereket k�nnyed�n �ssze lehet t�veszteni robotokkal, �s g�pies k�lsej�kb�l ered�en sz�mos g�nynevet is kapott a sorozat a hagyom�nyos Lego rajong�it�l. Az igazs�g viszont az, hogy a Bionicle �l�l�nyei t�bbnyire egy�ltal�n nem robotok, hanem biomechanikus �l�l�nyek. Bels� szerveik, izmaik organikus sz�vetekb�l �p�lnek f�l, m�g b�r�k helyett protodermisz, protoac�l vagy m�sfajta anyag� p�nc�l �s kisebb g�pszer� alkatr�szek fedik �ket. Ezek pontos ar�nya a mator�n univerzum lak�in�l 85% mechanikus alkatr�sz �s 15% organikus anyag. Egy�b Bionicle vil�gok lak�in�l az ar�nyok m�sok. A Bara Magna nev� bolyg� l�nyei p�ld�ul teljesen organikusan sz�letnek, �s csak k�s�bb, fokozatosan adnak magukhoz g�pi elemeket, amelyek gyakorlatilag implant�tumokk�nt m�k�dnek. Term�szetesen l�teznek teljesen robotikus szerepl�k is, akiket nem lehet igaz�b�l „�l�l�nynek” tekinteni. Ilyenek p�ld�ul a Bohrok, vagy a Verem �rrobota Maxilos, m�g a Rahkshik csup�n p�nc�lzatok, amikbe Kraata f�rgeknek kell beleb�jniuk.

A teljesen organikus l�nyek m�r ritk�bbak a mator�n univerzumon bel�l, �s a „hagyom�nyos” biomechanikus l�nyek �ltal�ban megh�kkenve tekintenek r�juk. Vannak olyanok is, akik nem is rendelkeznek testtel: ilyenek a Makut�k, akik esszenci�ja az antidermisznek nevezett szellemszer� g�z.

Azonban att�l, hogy a szerepl�k t�bbs�ge nem g�p, m�g nem szabad azt felt�telezni, hogy term�szetes m�don j�ttek a vil�gra. A mator�n univerzum lak�it egyt�l-egyig m�s l�nyek alkott�k vagy teremtett�k meg (az els�ket a Nagy L�nyek „hozt�k a vil�gra”, �m a Nagy Szellem, Mata Nui �s a Makut�k is kivett�k r�sz�ket a teremt�sb�l), hogy gyakorlatilag robotokk�nt m�k�dve l�ss�k el a nekik kiszabott feladatk�r�ket. A jelek arra vallanak, hogy a Nagy L�nyek hib�kat v�tettek teremt�seik k�zben, �s a teljes mator�n kult�ra �s mitol�gia l�trej�tte (melyek feleslegesek lenn�nek munk�ik elv�g�se szempontj�b�l) is erre az alapvet� hib�ra vezethet� vissza.

�ltal�nosan minden �rtelmes mator�n univerzum-b�li Bionicle l�nyre jellemz�, hogy van egy j�s�gos f�ny �s egy gonosz �rny�k oldala, de ezekhez �nmagukt�l nincs hozz�f�r�s�k. Ezek az oldalak a l�nyek elveihez, mor�ljaihoz k�t�dnek. A nem gondolkod� l�nyeknek, �gy a Rahi vadaknak val�sz�n�leg nincs elk�l�n�thet� f�ny �s �rny�k oldaluk. Ha valamilyen m�don egy l�ny behatol a saj�t �rny oldal�ba, akkor elvesz�ti a f�ny�t, �s gonosz lesz, egyszersmind �rny�k alap� er�kre tesz szert. F�ny elsz�v�s�ra k�pesek p�ld�ul a nemr�g kifejlesztett �rny�kpi�c�k, melyekkel a Makuta Testv�ris�g�nek tagjai hoztak l�tre �rny�k mator�nokat. A f�nyt�l megfosztott l�nyeket az �rny�kpi�c�k j�volt�b�l k�r�lveszi egyfajta pajzs is, ami a f�ny behatol�s�t hivatott megakad�lyozni azok test�be, akikt�l elvont�k azt. Ha ezt a l�thatatlan pajzsot megt�rik, a f�ny szabadon be�ramlik, hogy kiegyenl�tse a f�ny-�rny�k eloszl�s�t a testben. Erre egyed�l a Klakk nev� rep�l� vad�llat k�pes, sz�nikus sikoly�val. Ugyanakkor olyan esetr�l sincs eddig tudom�sunk, hogy valaki a f�ny oldal�ba hatolt volna be, hiszen ezt sokkal nehezebb megtenni, mint a s�t�t oldalba behatolni. Egy k�l�n�s esetet jelk�pez az eddigi F�ny To�ja, Takanuva, akit egy �rny�kpi�ca t�madott meg. Miel�tt azonban minden f�ny�t kisz�vhatta volna, a pi�c�t meg�lt�k, s �gy Takanuva f�lig �rny�k erej�v� v�ltozott. Most m�r a F�ny �s �rny�k To�j�nak h�vj�k, nem kanonikus beceneve a „F�lhom�ly” To�ja. A f�nyt eddig Karda Nui f�ny-mator�n n�pess�g�nek nagy r�sz�b�l t�vol�tott�k el teljesen, valamint Vicanb�l, aki egy le-mator�n volt, �s meg akarta v�ltoztatni az �let�t. Az�ta minden �rny�k mator�n �s Takanuva visszav�ltozott norm�liss�, h�la az egyetlen ismert Klakknak, amely sajnos nem sokkal k�s�bb, Mata Nui fel�bred�sekor, az �let�t vesztette. A Makut�kban pedig m�r egy�ltal�n nem maradt f�ny, �s mivel �k sz�nd�kosan v�ltak meg t�le, pajzs sem veszi �ket k�r�l, ami megakad�lyozn� a vissza�raml�s�t. Egy n�nem� Vortixx is ismert, Roodaka, aki szint�n behatolt saj�t �rny�k oldal�ba.

A „Bionicle univerzum” kifejez�s 2001-t�l, vagyis a sorozat kezdet�t�l eg�szen 2008-ig azonos volt a „mator�n univerzum”-mal, azzal a vil�ggal, amelyet a mator�nok (alighanem a leggyakoribb, leg�ltal�nosabb �l�l�nyei a vil�guknak) ismertek. Azonban miut�n kider�lt, hogy az univerzum maga val�j�ban egy Bionicle szerepl�, Mata Nui, �s a 2008 ut�n j�tsz�d� t�rt�net m�r kil�p ebb�l az univerzumb�l, a k�t kifejez�s t�bb� nem lehet egyen�rt�k�. Teljes le�r�st a Bionciel t�rt�net�r�l k�ptelens�g lenne �rni, ugyanis csak nagyon kev�s inform�ci� �ll a rajong�k rendelkez�s�re a Bioncle vil�gmindens�g�nek kezdeti szakaszair�l, a mator�n univerzumot teremt� Nagy L�nyekr�l, valamint az ind�t�kaikr�l. Azonban a k�zelm�lt felfed�sei (els�sorban a BionicleStory.com oldalon megjelen� t�rt�neti fejezetek ) lehet�v� teszik, hogy nagy vonalakban fel lehessen v�zolni egy levezet�st az ismert Bionicle t�rt�nelemb�l, �s a jelent�sebb alapesem�nyekb�l.